Биологический факультет был основан наравне с учреждением Университета в 1948 году. Его профессорско-преподавательский состав и сотрудники сыграли огромную роль в подготовке высококвалифицированных специалистов в различных областях биологической науки
В первый год учреждения факультета для обучения студенты были одновременно приняты на два курса (первый и второй). Поэтому первые воспитанники биологического факультета окончили Университет в 1952 году, среди которых хочется отметить таких выдающихся людей, как доктор биологических наук, профессор Л. И. Исмоилова (обладательница диплома № 1 Университета) и А.М. Глазунова.
В 1954 году при биологическом факультете было учреждено отделение геологии, которое впоследствии стало называться факультетом естествоведения. С 1964 года одновременно с преобразованием в отдельный факультет отделения геологии и до сегодняшнего дня биологический факультет самостоятельно ведёт свою деятельность под своим первым названием.
В разные периоды времени факультетом руководили известные люди и достойные учёные, внёсшие весомый вклад в его развитие: доктор биологических наук, профессор Д.И. Иваненко (1948-1954 годы), кандидат биологических наук, доцент Ф.Г. Тверитнев (1954-1958 годы ), кандидат биологических наук, доцент А.Ш. Шукуров (1958-1962 годы), кандидат биологических наук, доцент Љ.А. Бузруков (1962-1964 годы), доктор биологических наук, профессор И.К. Лопатин (1964-1970 годы), кандидат биологических наук, доцент К.Н. Ниматджонова (1970-1977 годы), доктор биологических наук, профессор Х.М. Сафаров (1977-1994 годы), доктор биологических наук, профессор Б.Г. Гафуров (1994-2002 годы), и доктор биологических наук Т.Дж. Гиёсов (2002-2008 годы).
Необходимо отметить, что в становлении и подготовке высококвалифицированных специа- листов, прежде всего, хочется отметить огромный вклад талантливых воспитанников факультета (Университета) преподавателей А.Ш. Шукурова, И.К. Лопатина, Х.М. Сафарова, М.И. Исмоилова, М.М. Ёкубову, М.А. Бободжонову, О.А. Старкова, В.И. Чикатунова, А.Х.Кодирова, М.Д.Дарвозиева, М.Б.Устоева, Њ.Ю.Юлдошева и многих других. Они сыграли выдающуюся роль в создании тесного научно-образовательного сотрудничества кафедр с крупнейшими научными центрами городов Москва, Санкт-Петербург, Новосибирск и повышении уровня научных работ преподавателей. Все сегодняшние преподаватели действующих кафедрах факультета преподают различные учебные дисциплины и проводят научные исследования в различных отраслях науки, они пользуются заслуженным авторитетом у студентов.
В настоящее время на шести кафедрах факультета занимаются обучением и воспитанием студентов и проводят научно-исследовательскую работу 47 преподавателей, из которых 10 докторов наук, профессоров и 19 кандидатов наук, доцентов.
Воспитанники факультета, каждым из которых мы гордимся, осуществляют свою деятельность в Академии наук, Университетах, Министерстве образования и науки и почти во всех сферах народного хозяйства, управления и руководства (как в самой республике, так и за её пределами).
С первых лет учреждения факультета и до 1994 года студенты обучались при 5 его кафедрах (ботаники, зоологии, физиологии растений и биохимии) на дневном и заочном отделениях по одной специальности – 011600-биология и заканчивали Университет. В 1994 году на базе кафедры экологии биологического факультета студенты стали обучаться по специальности 013100-экология на дневном и заочном отделении. Также необходимо отметить, что факультет с момента учреждения в 2009-2010 учебном году медицинской кафедры и на её базе и на базе действующих кафедр был организован набор студентов для обучения на дневном отделении по двум специальностям медицинского направления: 1-790108001- фармацевтика и 1-79010400 – медицинско-диагностические работы. Не без гордости хочется отметить, что за 60 лет биологический факультет подготовил более 10 тысяч специалистов. Большинство из них, осуществляя свою деятельность в научно-исследовательских институтах, университетах, медицинских учреждениях, санитарно-эпидемиологических центрах и других отраслях народного хозяйства республики, внесли весомый вклад в развитие биологической науки. В подтверждение хочется сказать о таких воспитанниках факультета, как академик АСХН РТ доктор биологических наук, профессор ныне покойный Х.М. Сафаров (ректор ТГНУ, 1994-2002 годы), академик АН РТ, доктор биологических наук, профессор ныне покойный П.Дж.Усмонов (заведующий кафедрой генетики НИИ физиологии растений и генетики АН РТ, 1975-2006 годы), академик АН РТ, доктор биологических наук, профессор М.М.Ёкубова (заведующая кафедрой биохимии с 1974 года и по сей день), действительный член АН РТ, доктор биологических наук, профессор К.А. Алиев (заведующий Лабораторией молекулярной биологии и генной геометрии НИИ физиологии растений и генетики АН РТ, почти 30 лет является руководителем дипломных работ студентов, магистрантов и аспирантов факультета, читает студентам и магистрантам общие и специальные курсы), действительный член АН РТ, доктор биологических наук, профессор ныне покойный Х.К.Гафуров, (директор НИИ зоологии и паразитологии АН РТ, 1992-2005 годы), доктор философских наук, профессор К.Р. Расулов (ректор ТГПУ им. С. Айни, 1994-2002 годы), действительный член МАН ВШ, доктор биологических наук, профессор Б.Г. Гафуров (декан биологического факультета, 1994 -2002 годы) и многие другие, занявшие достойное место в ряду основоположников биологической науки республики.